Zabbixのチューニングで一番影響が大きいのは、DBMSのチューニングです。
CentOSなどのデフォルトの設定では、サーバに搭載(用意)されたメモリを有効に活用できる設定にはなっていません。
例えば、MySQLを利用する場合は、innodb_buffer_pool_sizeなどの調整が必要です。
他にも色々と設定項目がありますので、以下に添付するURLにあるスライドなどをご確認ください。
ご参考:
「Zabbixのパフォーマンスチューニング&インストール時の注意点」
http://www.slideshare.net/KodaiTerashima/zabbix-12061530
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